At5g63080(JMJ20) ORF Clone

产品内容

pLinker1-At5g63080------------------------2 μg

TE buffer--------------------------------------500 μl

产品信息

产品名称：At5g63080(JMJ20) ORF Clone

产品货号：QA5g63080

别称：JMJ20;At5g63080;MDC12.4

产品类型：ORF克隆载体

基因ID：At5g63080

转录本：AT5G63080.1

载体：pLinker1

抗性：kanR

ORF 长度：1389 bp

蛋白长度：462 aa

蛋白分子量：54358 Da

片段物种：拟南芥（Arabidopsis thaliana）

NCBI gene ID：836428

Uniprot ID：Q67ZB6

基因摘要

Encodes a HR demethylase that acts as a positive regulator of seed germination in the PHYB-PIL5-SOM pathway.

ORF 核苷酸序列

>At5g63080(JMJ20) ORF Clone

ACGCTAGCATGGATGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTCTTAAGCTCCAGTGAATTCGAGCTCGGTACCTCGCGAATGCATCTAGATATC

ATGGGAATACAGATTATAGGTCAAATTGAGAGAATCAATGGTAAAGAGCTGAGTTACGGCGATTTTGCAGAGAGATACTTAGCTAAGAACCAGCCAGTGGTAATATCCGATCTCACTGAAGATTGGCGAGCTCGGGAAGATTGGGTCAGTGAGAATGGAAACCCTAATCTCCACGTATTTGCCACTCACTTTGGAAAATCCAGAGTTCAGGTTGCAGATTGTGATACGAGAGAATTTACAGATCAGAAAAGATTAGAAATGTCTGTTACTGAATTTGTGGAGCAATGGACTAATAAGGATTCTATTGAGGAATCTGTTTTGTATCTGAAAGATTGGCACTTTGTGAAGGAGTATCCAGACTATACAGCTTACCAAACACCGCCGTTGTTTTCTGATGATTGGCTTAACGTGTATCTAGACAATTACCAAATGCATGAGGATAGAGATAGTTTCCAGAAGTATGATCAAATAAGCTGCTCTGATTATCGGTTTGTTTATATGGGTGGGAAAGGATCTTGGACACCTCTACATGCTGATGTATTTAGATCTTATAGTTGGTCAGCTAATGTCTGTGGTAAAAAAAGATGGCTTTTCCTTCCTCCTCCTCAAAGTCATCTTGTTTATGACAGGTACATGAAAAATTGCGTTTATGACATTTTTGAAGAGGTGAATGAAACTAAATTCCCTGGTTTTAAGAAGACCACCTGGCTTGAGTGCATTCAAGAACCCGGTGAAATTATCTTTGTTCCCAGTGGATGGCATCATCAAGTATATAACTTGGAAGACACAATATCTATTAACCACAATTGGCTCAACGCATACAACCTATCTTGGGTGTGGGATCTACTGTGGAAGGACTACAAGGACACTGAAGAGTCAATAGAAGACATAAGAGACATATGTGATGATTTTGAAGCTATCTGCCAACGTAATCTTGCTGCCAACACAGGAATGAATTTAAATGATTTCTTCCTCTTCATGTCACGGTTCTCTTTGGGGAACATGGTTCTACTGCAATCTTACTCTGACAAACACAAAAACCTGAATTCGTGTTCATTAGCAATGGCCCAAAACCTGTTAATGAATCTCTCAACTATACTGAAAGTCATGATGAAGATGATATCTGCAGGCGGTGTAACTGCAGAGGAAGTGTATCTGGACTTGCGAGAAACACTGGAGGATCCACAGTTTCTCAGATTTGTCAGAGACATGGGAAGAACTTATGCAAGGATTCACATGGAGGAAGAGGATCAGTTTCTTTCTTCGAAAGAATTATTACAAAAGCTCAGTGGTCTTGCAGGTCCAAATATGCAAATATGTTCTCCAAAGGATCTTGTTGAAATGATAAACCATCACAATACTTTTTCCTCCCAAATCTATTTTATTTAG

GATATCGGATCCCGGGCCCGTCGACTGCAGAGGCCTGCATGCAAGCTTGGCGTAATCATGGTCATACCCTATAGTGAGTCGTATTACATGGTCATAGCTG

黑色：载体序列、红色：同源重组序列、绿色：EcoR V酶切位点、蓝色：ORF序列

蛋白简介

Histone demethylase that demethylates 'Arg-3' (H4R3me) of histone H4 with a specific activity for H4R3me2 (PubMed:22483719). Involved in the positive regulation of gene expression (PubMed:22483719). Together with JMJ22, regulates positively seed germination by promoting the removal of repressive histone arginine methylations (e.g. H4R3me2) at GA3ox1 and GA3ox2 to trigger gibberellic acid (GA) biosynthesis (PubMed:22483719). {ECO:0000269|PubMed:22483719}.

蛋白质序列

>Arginine-specific demethylase JMJ20 (EC 1.14.11.-) (Arginine-specific histone demethylase JMJ20) (Jumonji domain-containing protein 20) (AtJMJ20) (Protein JUMONJI 20) ([histone H4]-dimethyl-L-arginine(3) monodemethylase JMJ20)

MGIQIIGQIERINGKELSYGDFAERYLAKNQPVVISDLTEDWRAREDWVSENGNPNLHVFATHFGKSRVQVADCDTREFTDQKRLEMSVTEFVEQWTNKDSIEESVLYLKDWHFVKEYPDYTAYQTPPLFSDDWLNVYLDNYQMHEDRDSFQKYDQISCSDYRFVYMGGKGSWTPLHADVFRSYSWSANVCGKKRWLFLPPPQSHLVYDRYMKNCVYDIFEEVNETKFPGFKKTTWLECIQEPGEIIFVPSGWHHQVYNLEDTISINHNWLNAYNLSWVWDLLWKDYKDTEESIEDIRDICDDFEAICQRNLAANTGMNLNDFFLFMSRFSLGNMVLLQSYSDKHKNLNSCSLAMAQNLLMNLSTILKVMMKMISAGGVTAEEVYLDLRETLEDPQFLRFVRDMGRTYARIHMEEEDQFLSSKELLQKLSGLAGPNMQICSPKDLVEMINHHNTFSSQIYFI

关键词

Gibberellin signaling pathway;Iron;Metal-binding;Nucleus;Oxidoreductase;Reference proteome


质粒图谱

产品说明

本产品是经过离子交换柱纯化后，装在无菌冻存管中通过真空干燥获得的2 μg连有At5g63080(JMJ20) 基因ORF的质粒DNA干粉。

保存：-20 ℃

使用说明

1、以5000 × g离心5 min；

2、打开冻存管，加入20 μL无菌水溶解DNA，并在室温下孵育10 min；

3、短暂涡旋冻存管，然后瞬时离心 (小于5000 × g)。

4、质粒溶液在-20℃下可稳定保存一年，请避免反复冻融。


扩增方案

1、收到质粒干粉后请先5000 rpm离心1 min，再加入20 μL无菌水溶解质粒，室温放置1 min；

2、从-80 °C冰箱中取出相应的感受态，置于冰盒上解冻，并做好标记；

3、取2 μL质粒加至100 μL感受态中，冰浴30min;

4、42 °C热激90 s，再冰浴2 min;

5、加入900 μL无抗的LB液体培养基，200 rpm震荡培养45 min;

6、5000 rpm离心5 min，仅留100 μL上清混匀菌体沉淀；

7、混匀后的菌液加至对应抗性的LB平板上，倒入适量玻璃珠，涂匀液体；

8、将平板正向培养1 h，再倒置培养12 h～16 h;

9、挑取单克隆菌落至对应抗性的LB液体培养基中，震荡培养12 h~16 h，根据实验需要提取质粒。

注意事项

1、同一个基因的单个转录序列可能由于发生自然变异 (例如核苷酸多态性)而有所不同，每一种都有其自身有效的存在。

2、该克隆被工程化，但表达取决于基因的性质。

3、本产品仅限于科学研究，不得用于临床诊断或治疗，不得用于食品或药品。

4、为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。

Tair 网站：https://www.arabidopsis.org/servlets/Search?type=general&search_action=detail&method=1&show_obsolete=F&name=At5g63080&sub_type=gene&SEARCH_EXACT=4&SEARCH_CONTAINS=1
NCBI网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=836428
Uniprot 网站：https://www.uniprot.org/uniprotkb//entry

相关文献 (NCBI PubMed ID)

PMID: 9501997; 27862469; 18713399; 22483719