At5g63380(4CLL9) ORF Clone

产品内容

pLinker1-At5g63380------------------------2 μg

TE buffer--------------------------------------500 μl

产品信息

产品名称：At5g63380(4CLL9) ORF Clone

产品货号：QA5g63380

别称：4CLL9;At5g63380;K9H21.11;K9H21.8

产品类型：ORF克隆载体

基因ID：At5g63380

转录本：AT5G63380.1

载体：pLinker1

抗性：kanR

ORF 长度：1689 bp

蛋白长度：562 aa

蛋白分子量：61278 Da

片段物种：拟南芥（Arabidopsis thaliana）

NCBI gene ID：836457

Uniprot ID：Q84P23

基因摘要

Encodes a peroxisomal protein involved in the activation of fatty acids through esterification with CoA. At5g63380 preferentially activates fatty acids with increased chain length (C9:0 to C8:0) and thus shares characteristics with long-chain fatty acyl-CoA synthases. Also able to catalyze the conversion of OPDA to its CoA ester and is therefore thought to be involved in the peroxisomal β-oxidation steps of jasmonic acid biosynthesis.

ORF 核苷酸序列

>At5g63380(4CLL9) ORF Clone

ACGCTAGCATGGATGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTCTTAAGCTCCAGTGAATTCGAGCTCGGTACCTCGCGAATGCATCTAGATATC

ATGCTGACGAAAACCAACGACAGCCGTTTGATTGACCGGAGCTCCGGCTTCGATCAACGGACAGGAATCTATCACAGTCTTCGTCCCTCTCTTTCTCTACCTCCTATAGATCAACCTCTCTCCGCCGCCGAATTCGCGCTTTCTCTCCTACTCAAATCCTCACCACCTGCCACCGCCGGGAAAAACATTGAAGCCTTAACCTACCTAGTTAACTCGAGCTCTGGTGATAACCTCACTTATGGAGAGCTTCTTCGTAGAGTTCGTTCTCTTGCTGTATCTCTCCGGGAGCGATTTCCTTCTCTTGCCTCCAGAAATGTCGCTTTTATCCTCTCTCCTTCTTCGTTGGACATACCAGTGCTTTACTTAGCTTTGATGTCGATCGGTGTTGTTGTTTCACCGGCGAACCCAATCGGATCTGAATCGGAGGTGAGTCATCAAGTCGAAGTCAGTGAACCAGTAATTGCGTTCGCGACATCGCAGACGGTTAAGAAGCTTCAATCCTCTTCTTTGCCTCTCGGAACTGTTCTGATGGACTCGACTGAGTTTCTCTCCTGGTTAAATCGATCGGATTCTTCATCGGTTAATCCATTTCAGGTTCAGGTCAACCAATCGGACCCTGCCGCTATCCTCTTTTCCTCTGGAACAACCGGGCGGGTCAAAGGCGTTTTGCTCACTCACCGTAACCTAATCGCCTCGACCGCCGTATCTCACCAACGGACTCTCCAAGATCCGGTTAATTACGATCGCGTTGGACTGTTCTCGCTTCCGCTCTTCCACGTGTTTGGTTTCATGATGATGATTCGAGCCATCTCGCTTGGAGAGACATTGGTGCTTTTAGGGAGATTTGAACTCGAGGCGATGTTTAAGGCGGTGGAGAAATATAAGGTTACTGGTATGCCTGTATCTCCTCCGTTGATTGTAGCGTTGGTCAAATCGGAGCTCACGAAGAAGTACGATCTCCGGTCGTTGCGTTCCCTTGGCTGCGGAGGAGCTCCACTCGGCAAAGACATCGCAGAGAGGTTTAAGCAGAAATTCCCAGATGTAGATATTGTACAGGGCTATGGCTTGACAGAGAGCTCGGGACCAGCTGCCTCAACGTTTGGACCTGAAGAGATGGTAAAATATGGCTCAGTTGGTCGTATCTCTGAGAATATGGAAGCCAAAATTGTTGATCCATCCACCGGAGAATCCTTGCCACCGGGAAAAACTGGTGAACTCTGGCTCCGAGGACCAGTCATCATGAAAGGTTATGTGGGAAACGAGAAAGCGAGTGCGGAGACAGTAGACAAAGAAGGGTGGTTAAAGACTGGTGATCTCTGTTATTTTGATTCGGAAGATTTTCTATATATTGTTGATCGGCTAAAGGAGCTAATCAAATACAAGGCTTATCAGGTTCCACCGGTAGAGTTGGAGCAGATTCTTCACTCGAATCCAGATGTGATTGATGCTGCAGTTGTTCCGTTCCCTGACGAGGATGCAGGAGAGATTCCAATGGCTTTCATAGTGAGAAAACCAGGAAGCAATCTCAACGAAGCGCAAATCATTGATTTCGTAGCTAAACAAGTTACTCCGTACAAGAAGGTAAGACGAGTTGCTTTTATAAATGCAATCCCAAAAAATCCTGCTGGCAAGATTCTGCGTCGGGAGCTTACTAAAATCGCTGTGGATGGCAATGCATCAAAACTTTGA

GATATCGGATCCCGGGCCCGTCGACTGCAGAGGCCTGCATGCAAGCTTGGCGTAATCATGGTCATACCCTATAGTGAGTCGTATTACATGGTCATAGCTG

黑色：载体序列、红色：同源重组序列、绿色：EcoR V酶切位点、蓝色：ORF序列

蛋白简介

Contributes to jasmonic acid biosynthesis by initiating the beta-oxidative chain shortening of its precursors (PubMed:15677481, PubMed:18267944). Converts 12-oxo-phytodienoic acid (OPDA) into OPDA-CoA (PubMed:15677481, PubMed:18267944). Follows a two-step reaction mechanism, wherein the carboxylate substrate first undergoes adenylation by ATP, followed by a thioesterification in the presence of CoA to yield the final CoA thioester (By similarity). {ECO:0000250|UniProtKB:O24146, ECO:0000269|PubMed:15677481, ECO:0000269|PubMed:18267944}.

蛋白质序列

>4-coumarate--CoA ligase-like 9 (EC 6.2.1.-) (4-coumarate--CoA ligase isoform 4) (At4CL4)

MLTKTNDSRLIDRSSGFDQRTGIYHSLRPSLSLPPIDQPLSAAEFALSLLLKSSPPATAGKNIEALTYLVNSSSGDNLTYGELLRRVRSLAVSLRERFPSLASRNVAFILSPSSLDIPVLYLALMSIGVVVSPANPIGSESEVSHQVEVSEPVIAFATSQTVKKLQSSSLPLGTVLMDSTEFLSWLNRSDSSSVNPFQVQVNQSDPAAILFSSGTTGRVKGVLLTHRNLIASTAVSHQRTLQDPVNYDRVGLFSLPLFHVFGFMMMIRAISLGETLVLLGRFELEAMFKAVEKYKVTGMPVSPPLIVALVKSELTKKYDLRSLRSLGCGGAPLGKDIAERFKQKFPDVDIVQGYGLTESSGPAASTFGPEEMVKYGSVGRISENMEAKIVDPSTGESLPPGKTGELWLRGPVIMKGYVGNEKASAETVDKEGWLKTGDLCYFDSEDFLYIVDRLKELIKYKAYQVPPVELEQILHSNPDVIDAAVVPFPDEDAGEIPMAFIVRKPGSNLNEAQIIDFVAKQVTPYKKVRRVAFINAIPKNPAGKILRRELTKIAVDGNASKL

关键词

ATP-binding;Fatty acid biosynthesis;Fatty acid metabolism;Ligase;Lipid biosynthesis;Lipid metabolism;Magnesium;Nucleotide-binding;Oxylipin biosynthesis;Peroxisome;Reference proteome


质粒图谱

产品说明

本产品是经过离子交换柱纯化后，装在无菌冻存管中通过真空干燥获得的2 μg连有At5g63380(4CLL9) 基因ORF的质粒DNA干粉。

保存：-20 ℃

使用说明

1、以5000 × g离心5 min；

2、打开冻存管，加入20 μL无菌水溶解DNA，并在室温下孵育10 min；

3、短暂涡旋冻存管，然后瞬时离心 (小于5000 × g)。

4、质粒溶液在-20℃下可稳定保存一年，请避免反复冻融。


扩增方案

1、收到质粒干粉后请先5000 rpm离心1 min，再加入20 μL无菌水溶解质粒，室温放置1 min；

2、从-80 °C冰箱中取出相应的感受态，置于冰盒上解冻，并做好标记；

3、取2 μL质粒加至100 μL感受态中，冰浴30min;

4、42 °C热激90 s，再冰浴2 min;

5、加入900 μL无抗的LB液体培养基，200 rpm震荡培养45 min;

6、5000 rpm离心5 min，仅留100 μL上清混匀菌体沉淀；

7、混匀后的菌液加至对应抗性的LB平板上，倒入适量玻璃珠，涂匀液体；

8、将平板正向培养1 h，再倒置培养12 h～16 h;

9、挑取单克隆菌落至对应抗性的LB液体培养基中，震荡培养12 h~16 h，根据实验需要提取质粒。

注意事项

1、同一个基因的单个转录序列可能由于发生自然变异 (例如核苷酸多态性)而有所不同，每一种都有其自身有效的存在。

2、该克隆被工程化，但表达取决于基因的性质。

3、本产品仅限于科学研究，不得用于临床诊断或治疗，不得用于食品或药品。

4、为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。

Tair 网站：https://www.arabidopsis.org/servlets/Search?type=general&search_action=detail&method=1&show_obsolete=F&name=At5g63380&sub_type=gene&SEARCH_EXACT=4&SEARCH_CONTAINS=1
NCBI网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=836457
Uniprot 网站：https://www.uniprot.org/uniprotkb//entry

相关文献 (NCBI PubMed ID)

PMID: 12805634; 10718197; 9501997; 27862469; 14593172; 12819348; 15677481; 18267944